在兼顧傳統化學系的各主要教學領域(有機、無機、分析與物化)外,本系發展出有別於一般大學化學系缺乏的醫藥暨應用化學專長的教學特色。醫藥與材料科學其相關應用科技之基礎在於化學科學,而化學的知識與技術中,涵蓋醫藥與材料應用科技為目前尖端科學發展的目標與方向。本系期許能以化學視野角度出發為學界及產業界培育專業負責的醫藥化學及應用化學人才。